Приход в честь иконы Божией Матери «Знамение-Абалацкая» был создан по благословению Управляющего Новосибирской епархией епископа (ныне — Митрополита Новосибирского и Бердского) Тихона в 1992 году. Первоначально богослужения совершались в помещении ЖЭКа, однако, вскоре, из-за увеличившегося числа прихожан, пришлось искать новое, более просторное помещение. Несколько лет, пока не было закончено строительство храма, богослужения совершались в здании бывшего детского сада, переданного Приходу (ул. Народная, 75).
В 1994 году, епископом Тихоном был освящен закладной камень на месте будущего храма. 19 мая 1998 года, на Пасху, была совершена первая Литургия в нижнем храме во имя Праведного Иоанна Русского, исповедника, а 10 декабря 1998 года, в престольный праздник, — в главном храме.
Храм создавался по проекту архитектора П.А. Чернобровцева, при деятельном участии первого настоятеля иерея (ныне — протоиерея) Андрея Федорова. Большое участие в строительстве храма приняли администрации Новосибирской области, города Новосибирска, Калининского района, многие предприятия и частные предприниматели, прихожане, но наибольший вклад внес ныне покойный директор Новосибирского завода химконцентратов А.И. Белосохов. В память о главном строителе и благотворителе у стен Знаменского храма разбит Александровский сквер.
25 июля 2000 года епископом Сергием (Соколовым) был совершен чин полного освящения храма. Главный храм освящен в честь иконы Божией Матери «Знамение — Абалацкая» (память — 2 августа и 10 декабря по новому стилю), нижний храм — во имя святого Праведного Иоанна Русского, исповедника (память — 9 июня).
Престол в главном храме освящен епископом Сергием (Соколовым), антиминс освящен архиепископом Тихоном (Емельяновым) 20 июня 2005 года. Антиминс в нижнем храме (во имя Праведного Иоанна Русского, исповедника) освящен епископом Сергием (Соколовым) 06 апреля 1996 года.
Настоятели храма: протоиерей Андрей Федоров с 21.01.1993 г. по 14.04.2006 г.; иерей Дмитрий Сальников с 17.04.2006 г. по 16.08.2006 г.; иерей Виктор Гужва с 16.08.2006 г. по 23.04.2008 г.; иерей Александр Володюков с 23.04.2008 г. по 12.08.2008 г.; протоиерей Андрей Ромашко с 12.08.2008 г. по 22.03.2013 г.; протоиерей Дионисий Михалев с 23.03.2013 г. по 24.12.2015 г.; иерей Сергий Коновалов с 25.12.2014 г. по 03.03.2015 г.; иерей Владимир Добринов с 04.03.2015 г.
В храме находятся чтимые святыни, иконы с частицами мощей и отдельные ковчежцы с частицами мощей угодников Божиих, святых: апостола Андрея Первозванного, святителя Николая Чудотворца, преподобного Сергия Радонежского, священномученика Владимира, митрополита Киевского, святителя Филарета Московского, святителя Иннокентия Московского, святителя Иоанна Тобольского, благоверного и великого князя Александра Невского; святых отцов Киево-Печерских: священномученика Лукиана, преподобного Агапита врача, преподобного Алипия иконописца, преподобного Моисея Угрина, преподобного Иосифа многоболезненного, преподобного Феофила, Христа ради юродивого; святого праведного Иоанна Русского, исповедника.
Приход расположен в центре Калининского района г.Новосибирска на пересечении улиц Богдана Хмельницкого, Учительская и Народная. Население Калининского района составляет 183 тысячи человек.